Enzimler, vücutta bulunabilen kimyasal maddelerdir. Vücutta kimyasal reaksiyonlar başlatırlar.
Tarihçe
Enzim kelimesi, 1878 yılında Wilhelm Friedrich Kühne tarafından tanıtıldı ve Yunanca maya veya maya anlamına gelen yapay enzimon kelimesinden türemiştir. Bu daha sonra uluslararası bilime girdi. Uluslararası saf uygulamalı kimya birliği (IUPAC) ve uluslararası biyokimya birliği (IUBMB) birlikte, bu büyük madde grubunun temsilcilerini tek bir ortak grup olarak tanımlayan bir enzim terminolojisi geliştirdi. Tek tek enzimlerin görevlerini belirlemek için önemli olan, enzimleri görevlerine göre sınıflandıran isimlendirmedir.
Adlandırma
Enzimlerin isimlendirilmesi üç temel ilkeye dayanmaktadır. -Ase ile biten enzim adları, bir sistemdeki birkaç enzimi tanımlar. Enzim adının kendisi, enzimin başlattığı (katalizlediği) reaksiyonu tanımlar.
Enzim adı aynı zamanda enzimin bir sınıflandırmasıdır. Ek olarak, enzimlerin dört sayıdan oluşan bir sayısal kod altında bulunabileceği bir kod sistemi, EC sayı sistemi geliştirilmiştir. İlk sayı enzim sınıfını gösterir.
Tüm kayıtlı enzimlerin listeleri, belirtilen enzim kodunun daha hızlı bulunabilmesini sağlar. Kodlar, enzimin katalize ettiği reaksiyonun özelliklerine dayansa da, sayısal kodlar pratikte kullanışsızdır. Daha sık kullanılanlar, yukarıda belirtilen kurallara göre tasarlanmış sistematik isimlerdir.
Örneğin, birkaç reaksiyonu katalize eden enzimlerle ilgili isimlendirme sorunları ortaya çıkar. Bu nedenle, bazen onlar için birkaç isim vardır. Bazı enzimlerin önemsiz isimleri vardır ve bunlar bahsedilen maddenin bir enzim olduğunu göstermez. İsimler geleneksel olarak yaygın olarak kullanıldığından bazıları muhafaza edilmiştir.
Enzim fonksiyonuna göre sınıflandırma
IUPAC ve IUBMB'ye göre enzimler başlattıkları reaksiyona göre altı enzim sınıfına ayrılır: Bazı enzimler birkaç, bazen çok farklı reaksiyonları katalize edebilir. Durum böyleyse, birkaç enzim sınıfına atanırlar.
- Oksidoredüktazlar Oksidoredüktazlar redoks reaksiyonlarını başlatır.
Bu kimyasal reaksiyonda elektronlar bir reaktanttan diğerine aktarılır. Bu, bir maddenin elektron salınımı (oksidasyon) ve başka bir madde tarafından bir elektron kabulü (indirgeme) ile sonuçlanır. Katalize reaksiyonun formülü A ?? + B? A? + B?
A maddesi bir elektron (?) Salar ve oksitlenirken, B maddesi bu elektronu alır ve indirgenir. Bu nedenle redoks reaksiyonlarına indirgeme-oksidasyon reaksiyonları da denir.
Çoğu metabolik reaksiyon, redoks reaksiyonlarıdır. Oksijenazlar, bir veya daha fazla oksijen atomunu substratlarına aktarır.
- Transferazlar Transferazlar fonksiyonel grubu bir substrattan diğerine aktarır. Fonksiyonel grup, organik bileşiklerdeki, maddenin özelliklerini ve reaksiyon davranışını belirleyen bir grup atomdur.
Aynı fonksiyonel grupları taşıyan kimyasal bileşikler, benzer özelliklerinden dolayı madde sınıflarına ayrılır. Fonksiyonel gruplar heteroatom olup olmadıklarına göre bölünecektir. Heteroatomlar, ne karbon ne de hidrojen olmayan organik bileşikler içindeki atomlardır.
Örnek: -OH -> hidroksil grubu (alkoller)
- Hidrolazlar Hidrolazlar, su kullanılarak tersinir reaksiyonlarda bağları veya esterleri, esterleri, peptitleri, glikozitleri, asit anhidritleri veya CC bağlarını parçalar. Denge reaksiyonu: A-B + H2O? A-H + B-OH.
Hidrolazlar grubuna ait bir enzim, örneğin alfa galaktosidazdır.
- Lyases Lyases, sentazlar olarak da adlandırılır, karmaşık ürünlerin ATP'yi bölmeden basit substratlardan ayrılmasını katalize eder. Reaksiyon şeması AB? A + B'dir. ATP, adenosin trifosfattır ve nükleosid adenosinin trifosfatından oluşan bir nükleotiddir (ve bu nedenle nükleik asit RNA'nın yüksek enerjili bir yapı bloğu).
Bununla birlikte, ATP esas olarak her hücrede hemen mevcut olan enerjinin evrensel formudur ve aynı zamanda enerji sağlama süreçlerinin önemli bir düzenleyicisidir. ATP, diğer enerji depolarından sentezlenir (kreatin fosfat, glikojen, yağ asitleri) gerektiği gibi. ATP molekülü bir adenin kalıntısı, şeker ribozu ve üç fosfattan (?
ester (?) veya anhidrit bağında (?
ve ? ).
- İzomerazlar İzomerazlar, izomerlerin kimyasal dönüşümünü hızlandırır. İzomerizm, tam olarak aynı atomlara (aynı moleküler formül) ve moleküler kütlelere sahip, ancak atomların bağlantısı veya uzamsal düzeninde farklılık gösteren iki veya daha fazla kimyasal bileşiğin ortaya çıkmasıdır. Karşılık gelen bileşiklere izomerler denir.
Bu izomerler, kimyasal ve / veya fiziksel ve sıklıkla biyokimyasal özellikleri bakımından farklılık gösterir. İzomerizm esas olarak organik bileşiklerle, ancak aynı zamanda (inorganik) koordinasyon Bileşikler. İzomerizm farklı alanlara ayrılmıştır.
- Ligaz Ligazlar, kimyasal olarak kullanılan substratlardan daha karmaşık olan maddelerin oluşumunu katalize eder, ancak liyazların aksine, ATP bölünmesi altında sadece enzimatik olarak aktiftir. Bu nedenle, ATP bölünmesi ile elde edilen bu maddelerin oluşumu için enerji gereklidir.
