Tanım
Karboksipeptidazlar enzimler amino asitleri ayıran proteinler veya peptitler. Proteinler farklı amino asitlerden oluşan uzun zincirlerdir. Peptitler ayrıca amino asitlerden oluşur, ancak daha kısadır.
Amino asitlerin temel yapısı her zaman aynıdır. Bir karbon atomu ile bir nitrojen atomu arasındaki bağlantının kurulması önemlidir. Mecazi olarak konuşursak, bunu bir insan zinciri olarak hayal edebilirsiniz, sağ el karbon atomu ve sol el nitrojen atomudur.
Yani zincirin uçlarında atomlardan biri her iki uçta da serbest kalır. Karboksipeptidazlar, son amino asidi kesip ayırır. proteinler karbon atomunun serbest kaldığı yer. Sözde C-terminal ucu denir. Enzim yalnızca uçlarda bölünebildiğinden, buna ekzopeptidaz denir. Karboksipeptidazlar bir yandan sindirilen gıdanın bölünmesinde rol oynarlar, diğer yandan da yeni üretilen proteinleri değiştirir ve onları işlevsel durumlarına getirir.
Hangi karboksipeptidazlar var?
Karboksipeptidazlar, farklı sistemlere göre alt gruplara ayrılabilir. Bir sistem, karboksipeptidazları, tercihli olarak parçaladıkları amino asitlere göre böler. Bu sistemde, karboksipeptidazlar harflerle gösterilen birkaç gruba ayrılır.
En iyi bilinen gruplar, A ve B gruplarıdır. A grubunun karboksipeptidazları, dallı bir yapıya ve aromatik bir halkaya sahip olan amino asitleri ayırır. Bu halka karbon atomlarından oluşan özel bir yapıdır ve kendine has özelliklere sahiptir.
B grubunun karboksipeptidazları, tercihen pozitif yüklü amino asitleri ayırır. Karboksipeptidazların sınıflandırılması için diğer sistem, enzimler aktif merkezlerinin türüne göre. Aktif merkez, reaksiyonun gerçekleştiği enzim bölgesini ifade eder.
Karboksipeptidazlarda, aktif merkezde bir metal molekülün bulunduğu metalo-karboksipeptidazlar, aktif merkezde amino asit sistein bulunan tiol-karboksipeptidazlar ve serin karboksipeptidazlar arasında bir ayrım yapılır. aktif merkezde. Bununla birlikte, farklı aktif merkezler, hangi amino asidin bölündüğünü belirlemez. Serin karboksipeptidazlar sınıfı üçten oluşur enzimler: tripsin, kimotripsin, elastaz.
Görev, işlev ve etki
Farklı karboksipeptidazların görevleri çok çeşitlidir. İlk keşfedilen karboksipeptidazlar sindirimde bir rol oynasa da, bugün bilinen çoğu karboksipeptidaz diğer işlemler için önemlidir. Sindirimdeki karboksipeptidazların görevi, proteinleri kendi amino asitlerine ayırmaktır.
Bu süreç çok önemlidir çünkü bağırsak proteinleri değil, sadece tek tek amino asitleri emer. Karboksipeptidazlar, çeşitli proteinlerin olgunlaşma sürecinde vazgeçilmezdir. Proteinlerin üretildikten sonra tamamen işlevsel hale gelmesi için çeşitli modifikasyonların yapılması gerekir.
Örneğin, tek tek amino asitler karboksipeptidazlar tarafından ayrılır. Bununla birlikte, bu modifikasyon, sadece karboksipeptidazlar tarafından değil, aynı zamanda diğer enzimlerle etkileşim halinde de gerçekleştirilmektedir. Ayrıca, karboksipeptidazlar, farklı peptitlerin üretiminde rol oynar. Özellikle önemli bir peptit ensülin. Ayrıca çeşitli karboksipeptidazlar da ensülin.
