İzoflavonoidler, steroidal östrojene (kadın cinsiyet hormonu) benzer bir moleküler yapıya sahiptir ve bu nedenle aynı zamanda fitoöstrojenler. Bununla birlikte, hormonal aktiviteleri, memeli organizmasında oluşan östrojene kıyasla 100 ila 1,000 kat daha düşüktür. Kadın cinsiyetine kimyasal-yapısal benzerliklerinden dolayı hormonların , izoflavon gıda ile yutulan tip 2 östrojen reseptörüne bağlanabilir ve onu endojen östrojen için bloke edebilir. Buna göre, izoflavon endojen östrojen seviyeleri düşük olan menopoz sonrası kadınlarda daha östrojenik etki gösterirken, premenopozal kadınlarda izoflavonlar östrojen reseptörlerini bloke ederek antiöstrojenik etkiye sahiptir.
