Koronavirüs mutasyonları

Mutasyonlar normaldir

Yeni viral varyantların ortaya çıkması sıra dışı bir durum değil: Sars-CoV-2 patojeni de dahil olmak üzere virüsler, replikasyon sırasında genetik materyallerini rastgele bir şekilde tekrar tekrar değiştiriyor. Bu mutasyonların çoğu anlamsızdır. Ancak bazıları virüse karşı avantajlıdır ve yerleşir.

Bu sayede virüsler ortama ve konakçıya hızlı bir şekilde uyum sağlayabilmektedir. Bu onların evrimsel stratejilerinin bir parçasıdır.

WHO, yeni varyantları aşağıdaki kategorilere göre sınıflandırır:

  • İzlenmekte olan varyantlar (VBM) – Daha yüksek risk anlamına gelebilecek genetik değişikliklere sahip ancak etkileri hala belirsiz olan varyantlar.
  • İlgi duyulan değişken (VOI): Daha yüksek bulaşıcılığı öngören, bağışıklık veya teşhis testlerini atlayan veya önceki formlara kıyasla daha şiddetli hastalığı öngören genetik özelliklere sahip varyantlar.
  • Yüksek sonuçlu varyant (VOHC) – Yüksek sonuçlu varyant: Mevcut aşıların hiçbir koruma sağlamadığı varyant. Bugüne kadar bu kategoride SARS-CoV-2 varyantı bulunmuyor.

Virüs varyasyonları soylar veya soylar olarak gruplandırılıyor; böylece araştırmacılar sistematik olarak "koronavirüsün aile ağacını" kaydediyor ve belgeliyor. Her değişken, kalıtsal özelliklerine göre karakterize edilir ve bir harf-sayı kombinasyonu atanır. Ancak bu tanımlama, belirli bir virüs türünün diğerinden daha tehlikeli olup olmadığını göstermez.

Coronavirüs nasıl değişiyor?

Coronavirüsün “başarılı” bir şekilde evrimleşmesinin iki yolu var: İnsan hücresine daha iyi girebilecek şekilde değişerek daha bulaşıcı hale geliyor ya da adapte olarak bağışıklık sistemimizden “kaçmaya” çalışıyor:

Kaçış mutasyonu: Bunlar, koronavirüsün bağışıklık sisteminden “kaçmasını” sağlayan değişikliklerdir. Virüs daha sonra dış şeklini öyle bir şekilde değiştirir ki, ilk enfeksiyon veya aşıdan kaynaklanan (zaten oluşmuş) antikorlar artık onu daha az "tanıyabilir" ve etkisiz hale getirebilir. Buna aynı zamanda “kaçış mutasyonları” veya “bağışıklık kaçışı” da denir. Dolayısıyla ikinci enfeksiyonlar daha olası hale gelebilir.

Virüs varyantları nasıl gelişir?

Pandemi ne kadar uzun sürerse, enfeksiyon o kadar fazla olur, koronavirüsün varyasyonları ve mutasyonları da o kadar fazla olur.

Corona salgını yaklaşık iki yıldır devam ediyor: 05 Ocak 2022 itibarıyla Johns Hopkins Coronavirüs Kaynak Merkezi (CRC) dünya çapında yaklaşık 296 milyon enfeksiyon vakası rapor ediyor.

Coronavirüsün genetik materyalinde birden fazla değişiklik (varyasyon) biriktirmesi için yeterli fırsat.

Bu muazzam sayıda vaka ve buna eşlik eden Sars-CoV-2'deki genetik değişiklikler, çok sayıda yeni virüs varyantının artık geniş çapta yayılmasına yansıyor:

Delta: B.1.617.2 soyu

Sars-CoV-1.617.2'nin delta varyantı (B.2) da son aylarda (2021 sonbaharı) Almanya'da hızla yayıldı. İlk olarak Hindistan'da keşfedildi ve çeşitli karakteristik değişiklikleri birleştiren üç alt değişkene ayrıldı.

Bunlar bir yandan insan hücresi için “anahtar” olarak kabul edilen spike proteinindeki değişikliklerdir. Öte yandan B.1.617, (olası) kaçış mutasyonu olarak tartışılan değişiklikleri de sergiliyor.

Spesifik olarak, B.1.617 diğerlerinin yanı sıra aşağıdaki ilgili mutasyonları birleştirir:

Mutasyon D614G: Coronavirüsü daha bulaşıcı hale getirebilir. İlk modelleme, bunun B.1.617'yi en azından son derece bulaşıcı alfa varyantı (B.1.1.7) kadar kolay iletilmesini sağladığını öne sürüyor.

Mutasyon P681R: Araştırmacılar tarafından muhtemelen artan virülansla da ilişkilendirilir.

Mutasyon E484K: Beta varyantında (B.1.351) ve gama varyantında da (P.1) bulunmuştur. Virüsün halihazırda oluşmuş nötrleştirici antikorlara karşı daha az duyarlı olmasını sağladığından şüpheleniliyor.

Mutasyon L452R: Olası bir kaçış mutasyonu olarak da tartışılmaktadır. L452R mutasyonuna sahip koronavirüs suşları, laboratuvar deneylerinde bazı antikorlara kısmen dirençli çıktı.

Şu ana kadar Avrupa'da baskın olan delta varyantının yerini büyük adımlarla son derece bulaşıcı omikron varyantı almış gibi görünüyor.

Omikron: B.1.1.529 soyu

Omikron varyantı, ilk olarak Kasım 2021'de Botsvana'da keşfedilen en yeni koronavirüs mutasyonudur. Artık Dünya Sağlık Örgütü (WHO) tarafından resmi olarak yeni bir endişe verici varyant olarak sınıflandırılmıştır.

Eris: EG.5 soyu

Coronavirüsün EG.5 varyantı Omikron soyundandır. İlk olarak Şubat 2023'te tespit edildi. O günden bu yana dünyanın çeşitli ülkelerinde yayılıyor ve birçok yerde enfeksiyon sahnesine hakim oluyor. Aynı zamanda Yunan anlaşmazlık ve çekişme tanrıçasından sonra Eris olarak da adlandırılır.

EG.5, XBB.1.9.2 omikron varyantlarından türemiştir. ve XBB.1.5'tir ancak aynı zamanda spike proteininde (F456L) yeni bir mutasyona sahiptir. EG.5.1 alt dizisi ayrıca başka bir Q52H mutasyonunu da taşır.

EG.5 önceki varyantlardan daha mı tehlikeli?

EG.5'in ortaya çıkmasıyla birlikte korona enfeksiyonu vakalarının sayısı ve bununla birlikte hastaneye yatışlar yeniden artıyor. Dünya Sağlık Örgütü'ne göre şu ana kadar hastalığın şiddetinde herhangi bir değişiklik bildirilmedi. Bu nedenle DSÖ, EG.5'i ilgi duyulan bir değişken (VOI) olarak sınıflandırmıştır ancak endişe verici bir değişken (VOC) olarak sınıflandırmamıştır.

Sonbahara yönelik eşleşen destekleyici aşılar tam olarak EG.5'i değil, yakından ilişkili bir viral soyu (XBB.1.5) hedef alıyor. İlk klinik çalışmalar rapel aşılamanın EG.5'e karşı da etkili olduğunu göstermektedir.

Pirola: BA.2.86 soyu

BA.2.86 virüs varyantı da bir omikron türevidir. Varsayılan selefi BA.2'den spike proteinindeki 34 yeni mutasyonla farklılık gösteriyor, bu da onu Omicron'un en son olduğu gibi önceki formlardan benzer şekilde farklı kılıyor.

BA.2.86 ne kadar yaygındır?

Şu ana kadar bu varyant yalnızca birkaç kişide bulundu. Ancak şu anda genel olarak çok az test yapılıyor. Özellikle belirli viral varyantı belirleyen ayrıntılı testler nadirdir. Bilinen vakaların üç kıtadan (Kuzey Amerika, Asya ve Avrupa) gelmesi ve doğrudan ilişkili olmaması, Pirola'nın zaten fark edilmeden yayıldığını gösteriyor.

BA.2.86 önceki varyantlara göre daha mı tehlikeli?

Uyarlanmış aşılar BA.2.86'ya karşı etkili midir?

Eylül ayından itibaren mevcut olan aşılar XBB.1.5 varyantı için optimize edilmiştir. Başak proteini Pirola'nınkinden 36 bölümde farklılık gösterir. Bu nedenle enfeksiyona karşı korumanın azalması muhtemeldir. Ancak uzmanlar şiddetli seyirlere karşı korumanın hala devam ettiğine inanıyor.

Bilinen diğer virüs çeşitleri

Vahşi türden farklı olan ek Sars-CoV-2 virüs varyantları da geliştirildi, ancak uzmanlar şu anda bunları VOC olarak sınıflandırmamaktadır. Bu virüs suşlarına “İlgi Varyantları” (VOI) adı verilir.

Ortaya çıkan bu VOI'lerin pandemi üzerinde ne gibi bir etkisi olabileceği henüz belli değil. Halihazırda dolaşan virüs türlerine karşı mücadele etmeleri ve galip gelmeleri halinde, onlar da ilgili VOC'lere yükseltilebilir.

Özellikle ilgi duyulan varyantlar

  • BA.4: Omicron alt tipi, ilk olarak Güney Afrika'da keşfedildi.
  • BA.5: Omicron alt tipi, ilk olarak Güney Afrika'da keşfedildi.

İzleme altındaki varyantlar

"İzlenmekte olan değişkenler" (VUM) olarak adlandırılan değişkenler üzerinde daha fazla durulmaktadır; ancak bunlar hakkında hala güvenilir, sistematik veri eksikliği bulunmaktadır. Çoğu durumda, yalnızca onların varlığına dair kanıt mevcuttur. Bunlar, sporadik olarak ortaya çıkan varyantların yanı sıra halihazırda bilinen mutasyonların "değiştirilmiş" torunlarını da içerir.

ECDC'ye göre bu nadir VUM'lar şu anda şunları içermektedir:

  • XD – varyant ilk olarak Fransa'da tespit edildi.
  • BA.3 – Omikron varyantının alt tipi, ilk olarak Güney Afrika'da tespit edildi.
  • BA.2 + L245X – kaynağı bilinmeyen omikron varyantının alt tipi.

Sürümü düşürülen virüs çeşitleri

Devam eden Corona pandemisindeki enfeksiyon olayları dinamik bir şekilde gelişiyor, pandeminin farklı aşamalarında yaygın olan virüs varyantlarının bilimsel olarak anlaşılması ve değerlendirilmesi de aynı şekilde gelişiyor.

Alfa: B.1.1.7 soyu

Yetkililere göre, Coronavirüs varyantı Alfa (B.1.1.7) artık Avrupa'da neredeyse hiç dolaşmıyor. Alpha ilk olarak Birleşik Krallık'ta tespit edildi ve İngiltere'nin güneydoğusundan başlayarak 2020 sonbaharından bu yana giderek Avrupa kıtasına yayılıyor.

B 1.1.7 soyunda 17 mutasyonla dikkat çekici derecede yüksek sayıda gen değişikliği vardı. Bu mutasyonların birçoğu, N501Y mutasyonu da dahil olmak üzere çok önemli ölçüde spike proteinini etkiledi.

B.1.1.7'nin vahşi tip Sars-CoV-35'den yaklaşık yüzde 2 daha bulaşıcı olduğu düşünülüyor ve enfeksiyondan (önceden aşılama olmadan) gözlemlenen ölüm oranının da arttığı düşünülüyor. Ancak mevcut aşılar güçlü koruma sağlıyordu.

Alpha, resmi kurumlarla (ECDC, CDC ve WHO) anlaşma konusunda güçlü bir düşüş yaşıyor.

Beta: B.1.351 soyu

Mutant büyük olasılıkla Güney Afrika nüfusunun virüsle yüksek oranda istila edilmesinin bir sonucu olarak gelişti. Güney Afrika, 2020'nin yaz aylarında zaten büyük ölçekli korona salgınları kaydetti. Özellikle ilçelerde, virüs muhtemelen hızla yayılmak için ideal koşulları buldu.

Bu, pek çok insanın Sars-CoV-2'nin orijinal formuna karşı zaten bağışık olduğu anlamına geliyor; virüsün değişmesi gerekiyordu. Araştırmacılar böyle bir durumu evrimsel baskı olarak adlandırıyorlar. Sonuç olarak, diğer özelliklerinin yanı sıra daha bulaşıcı olması nedeniyle orijinal formdan daha üstün olan yeni bir virüs çeşidi ortaya çıktı.

Ön veriler Comirnaty aşısının B.1351 soyuna karşı da yüksek etkinliğe sahip olduğunu gösteriyor. Öte yandan VaxZevria'nın etkinliği, yazarlar Madhi ve arkadaşlarının ön beyanına göre azalmış olabilir.

Beta, resmi kurumlarla (ECDC, CDC ve WHO) anlaşma konusunda güçlü bir düşüş yaşıyor.

Gama: P.1 hattı

Daha önce B.1 olarak bilinen ve şimdi Gamma olarak adlandırılan P.1.1.28.1 adlı başka bir VOC, ilk olarak Aralık 2020'de Brezilya'da keşfedildi. P.1'in genomunda da önemli N501Y mutasyonu bulunuyor. Bu nedenle P.1 virüs türünün oldukça bulaşıcı olduğu kabul edilmektedir.

Gama ilk olarak Amazon bölgesinde gelişti ve yayıldı. Varyantın yayılması, Aralık 19 ortasında bu bölgede Kovid-2020 ile ilgili hastaneye yatışlardaki artışla aynı zamana denk geliyor.

Gama, ECDC, CDC ve WHO uzmanlarıyla uyumlu olarak keskin bir şekilde düşüyor.

Daha fazla gerilimi azaltılmış varyantlar

Her ne kadar çok sayıda yeni virüs çeşidi biliniyor olsa da, bu otomatik olarak daha büyük bir tehdit anlamına gelmiyordu. Bu tür varyantların (küresel) enfeksiyon insidansı üzerindeki etkisi küçüktü veya bastırılmıştı. Bunlar şunları içerir:

  • Epsilon: B.1.427 ve B.1.429 – ilk olarak Kaliforniya'da keşfedildi.
  • Eta: Birçok ülkede tespit edildi (B.1.525).
  • Theta: Daha önce P.3 olarak belirlenmişti, şimdi derecesi düşürüldü ve ilk olarak Filipinler'de keşfedildi.
  • Kappa: İlk olarak Hindistan'da tespit edildi (B.1.617.1).
  • Lambda: İlk olarak Aralık 2020'de Peru'da keşfedildi (C.37).
  • Mu: İlk olarak Ocak 2021'de Kolombiya'da keşfedildi (B.1.621).
  • Iota: İlk olarak ABD'de New York metropol bölgesinde keşfedildi (B.1.526).
  • Zeta: Daha önce P.2 olarak belirlenmişti, şimdi derecesi düşürüldü ve ilk olarak Brezilya'da keşfedildi.

Sars-CoV-2 ne kadar hızlı mutasyona uğruyor?

Gelecekte Sars-CoV-2, mutasyonlar yoluyla insan bağışıklık sistemine ve (kısmen) aşılanmış bir popülasyona uyum sağlamaya devam edecek. Bunun ne kadar hızlı gerçekleşeceği büyük ölçüde aktif olarak enfekte olan popülasyonun büyüklüğüne bağlıdır.

Bölgesel, ulusal ve uluslararası düzeyde enfeksiyon vakaları ne kadar fazla olursa, koronavirüs o kadar çoğalır ve mutasyonlar da o kadar sık ​​meydana gelir.

Ancak diğer virüslerle karşılaştırıldığında koronavirüs nispeten yavaş mutasyona uğruyor. Sars-CoV-2 genomunun toplam uzunluğu yaklaşık 30,000 baz çifti olduğundan uzmanlar ayda bir ila iki mutasyonun meydana geldiğini varsayıyor. Karşılaştırıldığında, grip virüsleri (influenza) aynı dönemde iki ila dört kat daha sık mutasyona uğrar.

Kendimi koronavirüs mutasyonlarından nasıl koruyabilirim?

Kendinizi bireysel koronavirüs mutasyonlarına karşı spesifik olarak koruyamazsınız; tek olasılık enfekte olmamaktır.

Coronavirüs mutasyonları nasıl tespit edilir?

Almanya'da dolaşımdaki Sars-CoV-2 virüslerini izlemek için sıkı bir raporlama sistemi var; buna "entegre moleküler gözetim sistemi" adı veriliyor. Bu amaçla ilgili sağlık otoriteleri, Robert Koch Enstitüsü (RKI) ve uzman teşhis laboratuvarları yakın işbirliği içinde çalışmaktadır.

Mutasyon şüphesi durumunda raporlama sistemi nasıl çalışıyor?

Öncelikle profesyonelce gerçekleştirilen her pozitif koronavirüs testi, ilgili kamu sağlığı birimine zorunlu olarak bildirilmeye tabidir. Buna bir test merkezinde, doktorunuzun ofisinde, eczanenizde ve hatta okullar gibi devlet tesislerinde yapılan koronavirüs testleri de dahildir. Ancak özel kendi kendine testler bunun dışındadır.

Kendi kendine test için hızlı koronavirüs testleri hakkında daha fazla bilgi için Corona kendi kendine test konusu özelimize bakın.

RKI daha sonra rapor edilen verileri ve dizi analizinin sonucunu takma adla karşılaştırır. Takma ad kullanmak, tek bir kişi hakkında sonuç çıkarmanın mümkün olmadığı anlamına gelir. Ancak bu bilgi, sağlık sistemindeki bilim insanlarının ve aktörlerin mevcut pandemik duruma ilişkin doğru bir genel bakış elde etmelerine yönelik veri temelini oluşturur. Bu, (gerekirse) politika önlemleri almak için durumun mümkün olan en iyi şekilde değerlendirilmesini sağlar.

Sıralama genom analizi nedir?

Sıralama genom analizi ayrıntılı bir genetik analizdir. Viral genom içindeki tek tek RNA yapı taşlarının tam dizisini inceler. Bu, yaklaşık 2 baz çifti içeren Sars-CoV-30,000 genomunun kodunun çözüldüğü ve daha sonra vahşi tip koronavirüsünkiyle karşılaştırılabileceği anlamına geliyor.

Bireysel mutasyonlar ancak bu şekilde moleküler düzeyde belirlenebilir ve "koronavirüs aile ağacı" içerisinde bir atama mümkün olabilir.

Bu aynı zamanda dünyadaki her ülkenin belirli koronavirüs varyantlarının tam yayılımını ayrıntılı olarak takip edemediğini de açıkça ortaya koyuyor. Bu nedenle mevcut raporlama verilerinde bir miktar belirsizlik olması muhtemeldir.